檢測項目:细(xì)菌/真(zhēn)菌
适用(yòng)样本(běn):純培養菌株(zhū)
采用(yòng)實(shí)时(shí)熒光(guāng)PCR技术,針(zhēn)对(duì)弧菌特(tè)异(yì)性(xìng)基因(yīn)設計(jì)引物(wù)和(hé)探針(zhēn)。PCR擴增过(guò)程中(zhōng),與(yǔ)模闆結合的(de)探針(zhēn)被(bèi)Taq酶分(fēn)解(jiě)产生(shēng)熒光(guāng)信(xìn)号(hào),熒光(guāng)定(dìng)量(liàng)PCR儀根(gēn)據(jù)檢測到(dào)的(de)熒光(guāng)信(xìn)号(hào)繪制出(chū)實(shí)时(shí)擴增曲(qū)線(xiàn),從而(ér)實(shí)現(xiàn)弧菌在(zài)核酸(suān)水(shuǐ)平上(shàng)的(de)菌株(zhū)鑒定(dìng)。本(běn)产品可(kě)鑒定(dìng)副溶血(xuè)性(xìng)弧菌、霍亂弧菌、創傷弧菌、拟态弧菌、溶藻弧菌、河(hé)弧菌等菌株(zhū)。
1、核酸(suān)提(tí)取(qǔ)
加热(rè)法:刮取(qǔ)至(zhì)少(shǎo)10个(gè)菌落(là),懸浮于(yú)100μL的(de)無菌水(shuǐ)中(zhōng),漩渦震蕩10s(如果(guǒ)菌落(là)未能(néng)均勻分(fēn)散(sàn),可(kě)适當延长(cháng)震蕩时(shí)間(jiān)),95℃或(huò)沸水(shuǐ)浴5min,冷(lěng)卻至(zhì)室(shì)温(wēn),12000rpm离心(xīn)5min,吸取(qǔ)上(shàng)清(qīng)。
试劑盒法:可(kě)使用(yòng)商品化(huà)的(de)试劑盒提(tí)取(qǔ)细(xì)菌的(de)基因(yīn)組DNA。
2、反(fǎn)應(yìng)體(tǐ)系(xì)配置
從试劑盒中(zhōng)取(qǔ)出(chū)預混液,充分(fēn)融化(huà),渦旋後(hòu)短暫离心(xīn),取(qǔ)20μL置于(yú)PCR管(guǎn)或(huò)PCR闆中(zhōng),然後(hòu)各(gè)取(qǔ)模闆5μL分(fēn)别加入(rù)PCR管(guǎn)或(huò)PCR闆中(zhōng)(每種(zhǒng)模闆要(yào)使用(yòng)2種(zhǒng)預混液),蓋好(hǎo)管(guǎn)蓋或(huò)闆膜,短暫离心(xīn),立即進(jìn)行PCR擴增反(fǎn)應(yìng)。
3、PCR擴增
PCR管(guǎn)或(huò)PCR闆置于(yú)PCR儀上(shàng),推薦反(fǎn)應(yìng)程序設定(dìng)如下(xià):反(fǎn)應(yìng)體(tǐ)系(xì)为(wèi)25μL,在(zài)第(dì)二(èr)步每个(gè)循环(huán)60℃时(shí)檢測熒光(guāng)信(xìn)号(hào),檢測通(tòng)道(dào)選擇FAM、HEX(VIC)、ROX、CY5。
第(dì)一(yī)步 | 第(dì)二(èr)步 | ||
1个(gè)循环(huán) | 40个(gè)循环(huán) | ||
95℃ | 95℃ | 60℃√ | 72℃ |
10min | 20s | 60s√ | 30s |
注:使用(yòng)ABI系(xì)列PCR儀器,如果(guǒ)不(bù)添加ROX,“passive reference”和(hé) “quencher”均選擇“none”。